Seiya é um órfão enviado ao Santuário da deusa Athena, na Grécia, para obter uma poderosa Armadura de eras mitológicas. Ele consegue despertar a fonte interior do poder de um Cavaleiro, o seu “Cosmo”, e retorna ao Japão como o Cavaleiro de Bronze de Pégaso para procurar sua irmã desaparecida. A neta do homem que o enviou, Saori Kido, promete encontrar sua irmã se ele competir no torneio da Guerra Galáctica para vencer a Armadura de Ouro de Sagitário. O evento é interrompido pelo vingativo Cavaleiro de Bronze de Fênix, Ikki, que é derrotado por Seiya e outros Cavaleiros de Bronze: Shun, Shiryu e Hyoga.
Eles então descobrem que Saori é a reencarnação da deusa Athena e que um homem corrupto, que tentou assassiná-la quando ainda era um bebê, agora governa o Santuário. Ciente do despertar de Saori como a deusa Atena, o Grande Mestre do Santuário envia os Cavaleiros de Prata para matar a ela e seus Cavaleiros de Bronze, que os derrotam em ferozes batalhas. Sem os Cavaleiros de Prata em suas fileiras, o Grande Mestre envia alguns Cavaleiros de Ouro para dar fim em Saori e em seus aliados, mas encontra dificuldades quando a armadura de Sagitário cobre Seiya para protegê-lo de Aioria de Leão e Mu de Áries interrompe a tentativa de Máscara da Morte de matar o Mestre Ancião de Libra.
Saori decide partir para o Santuário da Grécia para encerrar a longa batalha. Entretanto, ela é mortalmente ferida por uma flecha. Para salvá-la, os Cavaleiros de Bronze atravessam doze templos, cada um guardado por um dos imensamente poderosos Cavaleiros de Ouro. Ao chegar ao templo final, Seiya descobre que o governante é, na verdade, Saga de Gêmeos, um Cavaleiro de Ouro cuja personalidade maligna assassinou o legítimo governante. Com a ajuda de seus companheiros, Seiya derrota Saga, que então comete suicídio após sua natureza bondosa reassumir o controle, e Saori é curada.
Mais tarde, o deus Poseidon reencarna em Julian Solo e inunda o mundo. Saori e seus Cavaleiros viajam até seu templo submarino para detê-lo. Eles descobrem que o conflito está sendo manipulado por Kanon, o general de Dragão Marinho e irmão gêmeo de Saga. Após uma grande batalha, o espírito desperto de Poseidon é finalmente derrotado e sua alma é selada por Saori.
O conflito final começa quando Hades, deus do Submundo, é libertado de seu selo. Ele revive Cavaleiros de Ouro falecidos e envia-os para atacar o Santuário e matar Atena. Como parte de sua estratégia, Saori sacrifica sua vida para viajar diretamente ao Submundo, com seus Cavaleiros de Bronze seguindo-a. Lá embaixo, os Cavaleiros lutam contra o exército de Espectros de Hades, e a divindade possui o corpo de Shun. Saori confronta Hades-Shun e expulsa a alma maléfica do deus do Cavaleiro de Bronze, mas Hades a captura e a leva para os Campos Elísios. Os Cavaleiros de Bronze perseguem Hades até os Elísios e enfrentam Hades e os deuses gêmeos, Hypnos e Thanatos. Eles conseguem derrotar os deuses, embora Seiya seja mortalmente ferido pela espada de Hades. Saori e os Cavaleiros restantes retornam ao mundo dos vivos com seu corpo.