Gintama, Rurouni Kenshin & Nurarihyon no Mago
Tres samurais que juntos quebrariam as regras do uso de espada e honrado o codigo bushido, esses tres dariam um otimo trio em um crossovers, nem youkais, nem Makoto e nem aliens iriam escapar da espada destes tres, tambem com aliados de cada um deles.
To Love-ru & Ichigo 100%
Vamos começar pelas semelhanças, ambos são animes ecchi (carinha aquela ( ͡° ͜ʖ ͡°)), de To Love-ru - Rito Yuuki, Lala Satalin Deviluke & Haruna Sairenji & de Ichigo 100% - Junpei Manaka, Aya Toujou & Tsukasa Nishino;
os dois garotos rodeado de garotas, fariam um otimo crossover cheio de momentos pervertidos
Neon Genesis Evangelion & Shingeki no Kyojin
Dois grupos de caçadores de monstros gigantes que vivem aterrorizando os quarterões da cidade, imagina estes dois grupos enfrentando os anjos em forma de mecha em NGE e os Titãs em SNK, acho que seria as casas das muralhas ou predios caido depois de uma grande luta contra estes colossais monstros.
Hajime no Ippo & Ashita no Joe
Imagina esses dois lutando uma luta amigavel (amigavel por que são protagonistas, cada um de um anime diferente)
Mas este crossover já existe.